ตามคำสั่งนายกรัฐมนตรี ที่ 6/2553 ลงวันที่ 24 ธันวาคม 2553 เรื่อง มอบอำนาจให้ผู้ว่าราชการกรุงเทพมหานคร และผู้ว่าราชการจังหวัดปฏิบัติราชการแทนนายกรัฐมนตรี ข้อ 3 ระบุว่า “..ให้ยกเว้นการเลี้ยงสัตว์น้ำในโรงเพาะฟักสัตว์น้ำ บ่อเลี้ยงสัตว์น้ำของทางราชการ และสถานแสดงพันธุ์สัตว์น้ำที่มีอยู่แล้วในปัจจุบัน โดยไม่ให้มีการขยายพื้นที่เพิ่มขึ้นและต้องจัดให้มีระบบการบำบัดและควบคุม การปล่อยน้ำทิ้ง ตลอดจนมีการบริหารจัดการที่มีประสิทธิภาพเพื่อมิให้เกิดผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อมและพื้นที่ใกล้เคียงด้วย”
ดังนั้น เกษตรกรที่ดำเนินการเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำในโรงเพาะฟัก โดยมีการบำบัดอย่างถูกต้องและควบคุมการปล่อยน้ำทิ้งที่ไม่กระทบต่อสิ่งแวดล้อมและพื้นที่ใกล้เคียง รวมถึงไม่มีการขยายพื้นที่เพิ่มขึ้น ก็สามารถดำเนินการได้ นอกจากนี้ การเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำชนิดอื่นๆ ที่ไม่ใช้ความเค็มในการเพาะเลี้ยง ก็สามารถดำเนินการได้ตามปกติ