ในระยะแรกของการประกาศคำสั่งนายกรัฐมนตรีนั้น ได้มีข้อร้องเรียนจากสมาคม องค์กร หน่วยงานท้องถิ่น รวมทั้งประเด็นคำถามจากคณะกรรมาธิการการเกษตรและสหกรณ์ วุฒิสภา เกี่ยวกับปัญหาความเดือดร้อนที่จะเกิดขึ้น และขอให้ชะลอคำสั่งนายกรัฐมนตรี ซึ่งสำนักงานนโยบายและแผนทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมได้ชี้แจงข้อร้องเรียนดังกล่าว และได้ชี้แจงต่อคณะกรรมาธิการฯ ถึงเหตุผลความจำเป็นที่ไม่อาจชะลอการประกาศคำสั่งดังกล่าวได้ เพราะการดำเนินการที่ล่าช้า จะทำให้ผลกระทบจากการสะสมและแพร่กระจายความเค็มในพื้นดินและพื้นที่ใกล้เคียงมีเพิ่มมากขึ้น